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最近有不少同學在 學術查重 時，發現有些同學的碩士研究生畢業論文的腳注和尾注被學術當作論文正文查重了，腳注部分大部分被標紅當作重復內容，慘不忍睹；但有些同學的碩士論文的腳注卻被學術正確識別出來了，沒有當作重復部分，如下圖所示： 那么，什么情況下學術查重能正確識別出論文的腳注部分呢？
word格式里面標注的腳注：學術對word格式論文里面的腳注并不全部都識別，如果單個腳注的字數很少，比如幾十字，或者100字左右，那么，學術基本上是不識別腳注的內容的，也即是說會被忽略掉，如果單個腳注的內容長一些，比如超過了200字，那么學術會識別這個腳注，重復就會被標紅處理。 pdf格式里面標注的腳注：學術對pdf格式論文里的腳注全部都識別。
學術論文查重檢測是不檢測腳注的，而腳注會被標紅，可能是因為格式不正確，在提交論文時，文檔格式盡量提交docx文檔才能被正確識別，doc格式的文檔也是能夠識別的，只是沒有docx格式的文檔識別那么準確，因為在提交doc格式的文檔容易使腳尾注損壞，從而導致識別不出而被標紅。
一般來說，如果提交的論文是word版本，且腳注的標注是按照學校要求的格式進行標注的，90%的情況下來學術都能正確的識別出腳注，不會被當作論文的正文而被標紅。 據未經驗證的說法是腳注的標注位置比較關鍵，必須加在標點符號前面，不管對于句話還是引號，腳注都要加在標點符號的前面，這部分內容就不會被標紅或者標黃，僅供參考。 如果提交的論文是pdf格式，那么大部分pdf文件的腳注部分學術都無法正確的進行識別，從而會把腳注內容當作正文內容進行查重而被標紅。