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第二，維普查重使用的是關鍵詞識別技術，也就是說，即使文章作者的部分語句是自己原創的，但是只要其關鍵詞和其他文章的關鍵詞重復，維普查重也可能會自動識別該部分為疑似剽竊部分，這也是為什么諸如法學、經濟學等文章使用維普查重重復率高的原因所在。 關鍵詞識別技術雖然能夠在很大程度上識別大部分抄襲，但是也有可能會將作者的原創誤判為疑似剽竊部分，該計算規則相較于學術而言就更為嚴苛和不合理，這也是為什么大部分高校或者雜志社不適用維普查重的原因之一。
Paper系列和維普查重系統功能、使用范圍、檢測范圍、檢測原理等方面都有著很大區別。 假設學校是維普查重，那么paperok等其他系列的查重軟件也只能做初稿檢測參考。 paper系列因為其閥值比維普偏高，很多其實不相似的內容都會標紅，題目、目錄、參考文獻這些本身在學術一般都會自動識別到，而系列卻統統標紅導致重復率過高，從而讓我們覺得系列檢測比維普嚴格的假象，系列檢測重復率虛高的假象背后嚴格并不是準確。
維普查重提供片段對照報告、比對報告、原文對照報告、簡介報告、格式分析報告等5個版本報告，其中格式分析報告可以針對封面、目錄、摘要、關鍵詞、正文、聲明/致謝、參考文獻、附錄等進行分析，校驗是格式否符合規范，同時為論文自動推薦先關參考文獻。 片段對照報告通過表格的方式將送檢論文引用及相似文獻來源直觀地展現出來，通過片段對照報告我們可以清楚的看出所有與送檢論文相似的來源。